EzRobotをインストールしたPCをリモートデスクトップ経由で起動し操作することは可能か？

可能です。

注意点として、リモートデスクトップのソフトによっては接続元PCの解像度で画面解像度が変更されることがあるため、画像認識や座標指定を使用したシナリオに影響が出ることがあります。